Penyelenggaraan pendidikan tinggi dapat berupa pendidikan akademik dan pendidikan profesional. Pendidikan akademik mengutamakan peningkatan mutu dan memperluas wawasan ilmu pengetahuan dan terkait dengan gelar Program Sarjana, program Pasca Sarjana (Magister) dan Program Doktor.
Tujuan umum dari program gelar pada Fakultas Pertanian adalah memberikan pengalaman belajar menuju suatu keahlian akademik dalam bidang pertanian. Jenjang yang ada di Fakultas Pertanian Universitas Merdeka Pasuruan adalah Program Sarjana (Strata 1 – S1).
Program ini mempunyai beban studi kumulatif sebesar 144 sampai 160 SKS dengan lama studi 8 sampai 14 semester. Pada saat ini terdapat satu program studi yaitu program studi Agroteknologi.